01
引 言
在分子生物学的研究领域中,酶作为重要的生物催化剂,发挥着不可或缺的作用。其中,DNase I(脱氧核糖核酸酶I)作为一种能够消化单链或双链DNA的核酸内切酶,在核酸的研究、分析和操作中占据着关键地位。它就像一把精准的“分子剪刀”,能够特异性地切割DNA分子,为众多生物学实验提供了有力的工具。本文将深入探讨DNase I的来源、生产工艺、作用原理以及广泛用途。
02
DNase I的来源
01
动物来源
DNase I最初主要从牛胰腺中纯化得到。牛胰腺是RNase A的丰富来源,因此对于牛胰来源的DNase I去除RNase A的工艺非常关键;牛胰来源的DNase I的优势在于,来源广,能实现批量化生产,酶活高等优点;但是牛胰腺中可能含有其他杂质和污染物,增加了纯化的难度;另一方面,有些生物制品不能接受动物来源的DNase I,这时需要重组来源的DNase I来替换。
02重组来源
随着生物技术的发展,开始采用重组技术生产DNase I。目前,常见的重组表达系统包括酵母毕赤酵母和大肠杆菌(E. coli)菌株。这种生产方式可以降低污染RNase的水平。在重组大肠杆菌菌株中表达的DNase I,不含RNase,可用于各种RNA样品的处理,如RNA提取或反转录前去除基因组DNA,体外转录去除模板DNA等。重组技术的运用使得DNase I的生产更加高效、安全,并且能够更好地满足不同实验和应用的需求。但是重组技术生产DNase I既要实现高酶活,又要放大发酵工艺,确保低残留,这种工艺实现的难度较大,成本较高。
03
DNase I的作用原理
01
与底物的结合
DNase I首先通过静电相互作用与DNA双螺旋结构的磷酸骨架结合。
02水解反应
与DNA分子结合后,DNase I的活性中心结构域与DNA分子作用。使底物分子的磷酸二酯键断裂,生成相应的寡核苷酸片段。
03金属离子的作用
DNase I的活性依赖于钙离子(Ca²⁺),并能被镁离子(Mg²⁺)或二价锰离子(Mn²⁺)激活。
04
DNase I的用途
01
RNA纯化
在RNA提取过程中,常常会混入基因组DNA,这些DNA会对后续的实验结果产生干扰。例如,在进行mRNA表达量分析、转录组分析、RT—qPCR等下游实验时,DNA的存在会导致实验结果不准确。DNase I可以有效地去除RNA样品中的DNA污染,提高RNA的纯度。在提取RNA时,可以在裂解细胞后加入适量的DNase I,并在适宜的条件(37℃、pH=7—8)下进行孵育一段时间,DNase I将会发挥作用,特异性降解DNA分子,再进行后续的RNA提纯处理。该应用场景下,牛胰来源和重组来源都适用,牛胰来源的应用相对更广泛。
02体外转录
在体外转录实验中,常用T7、T3、SP6等RNA聚合酶进行RNA合成。然而,合成后的RNA可能会有DNA残留,若用于mRNA疫苗生产制作,则必须用DNase I去除模板DNA残留,且不能引入会引起免疫反应的杂质。例如,在制备mRNA疫苗时,需要确保RNA样品中不含有任何DNA污染,否则可能会影响疫苗的安全性和有效性。DNase I能够高效地去除模板DNA,保证RNA疫苗的质量。
03DNA研究
1. rRNAq去除,常应用于RNA建库测序
在酶法rRNAq去除实验步骤中,单链DNA探针和rRNA分子杂交结合;RNase H降解杂交的rRNA; DNase I降解DNA 探针;
2、DNase I足迹实验(DNase I footprinting),其原理是蛋白结合在DNA片段上,能保护结合部位不被DNase I破坏,DNA分子经酶切作用后遗留下该片段(即“足迹”),进而可以确定其序列。
3. 缺口平移(nick translation);该方法是DNase I与E.coli DNA Polymerase I的联合作用实现的。
4. 细胞凋亡TUNEL检测。
翌圣生物从牛胰腺中制备高纯度的DNase I,含有极低水平的核糖核酸酶和蛋白酶活性。我们提供不同的分装规格,以便客户在不同的应用场景下使用。牛胰来源DNase I适用以下应用场景:
·
RNA提取中去除不需要的DNA;
在RT-PCR之前从RNA制剂中去除基因组DNA;
DNA研究的相关应用。
翌圣生物在酶的定向进化和纯化工艺上积累了丰富的经验,我们提供重组来源DNase I。在重组大肠杆菌菌株中表达的DNase I,不含RNase。重组DNase I适用于以下应用场景:
RNA提取中去除不需要的DNA;
在RT-PCR之前从RNA制剂中去除基因组DNA;
在生物制药和生物加工过程中去除DNA。
·
DNA研究的相关应用。
·
05
DNaseI选择指南
Description |
Activity |
Catalog No. |
Size |
Price |
Application |
脱氧核糖核酸酶I(DNase I),来源于牛胰腺;经色谱工艺制备,核糖核酸酶A(RNase A)活性含量极低。为冻干粉剂。贮存温度-25℃~-15℃。 |
≥2000 Kunitz Units/mg protein |
10607ES |
10607ES15:15 KU 10607ES81:10×15 KU |
555.00 4155.00
|
从样本中提取RNA时去除gDNA。(如果是微量样本,需要用重组来源的DNase I) 蛋白质研究: 从蛋白制备物中去除 DNA。 |
脱氧核糖核酸酶I(DNase I),来源于牛胰腺;经色谱工艺制备,核糖核酸酶A(RNase A)活性含量极低。为冻干粉剂。贮存温度-25℃~-15℃。 |
≥2000 Kunitz Units/mg protein |
10608ES |
10608ES25:25mg 10608ES60:100mg 10608ES80:1g
|
875 .00 1275 .00 6505.00 |
|
重组来源DNase I (RNase-free),大肠杆菌重组表达,不含RNase,液体形式,贮存温度-25℃~-15℃。 |
2 U/μL |
10325ES |
10325ES80:1000 U 10325ES90:5×1000 U 10325ES91:5000 U |
495.00 2395 .00 2395 .00 |
适用于各种应用:从 RNA 和蛋白制备物中去除 DNA,如对RNase敏感的cDNA文库或用于RT-PCR实验样品制备。 |
重组来源DNase I (RNase-free),大肠杆菌重组表达,GMP-grade,液体形式,贮存温度-25℃~-15℃。 |
2 U/μL |
10611ES |
10611ES76:500U 10611ES84:2000U 10611ES92:10000U 10611ES98:100KU |
645.00 1965.00 6455.00 32275.00 |
GMP药用级别。用于采用药用规格原辅料生产,符合GMP规范的产品生产与质量管理规程保障生产过程及所有原辅料可追溯。 |